板卡出厂前一般都要经过清洗的程序，一般都是用专门的洗板水，将板卡清洗烘干后焕然一新再包装出厂。这样的洗板水经过去离子和去静电处理，不会腐蚀和击穿电路板。其实，我们自己也可以动手清洗主板，讲究一点的话就去买专用的洗板水，否则就用不导电的二次蒸馏水，以确保清洗的水不带静电离子。注意最好不要用我们常喝的矿泉水(含太多离子杂质)，也不要用自来水，这样的水经常呈弱酸或弱碱性，容易腐蚀电路板。
假如没有把握完全烘干，清洗前最好拔下板卡上的电池、集成块等，总之拔下能拔下的所有东西。在清洗的过程中要使用比较软的刷子，并注意不要碰坏零件和焊点、电容等。一般来说，CPU插槽、AGP槽、PCI槽、南桥和北桥芯片底下、每个集成电路IC芯片的底下、内存槽旁边的金属触点旁边，还有BIOS芯片底下，都是不容易清理的和烘干的地方。洗刷的时候还可以使用超声波清洗仪(眼镜店一般都有)来清洗很难洗刷或者看不见的污垢，但是同时也可能对元件造成损伤。烘干前，我们可以通过在主板上刷酒精以加快水分蒸发。烘干主板可以使用家用的电吹风，也可以拿到修车店用高压气泵吹干。烘干机最好用风流量比较大的，这样可以把不容易烘干的地方的水强制吹出来。烘干的时候一定要彻底，不然会导致局部短路，那样报废的可能就不仅仅是主板了。另外，主板烘干后要再晾一段时间，最好使用烘灯(或家用台灯)再烤24小时，以保证加电时不会有水蒸气存在。按照这个原则，电脑主机里的CPU、板卡、内存甚至硬盘的电路板都可以拿出来清洗。必须要注意的是，如果确认不是由于灰尘太多造成故障的，或者不是到了万不得已的时候，最好不要单纯为了好看而清洗配件，毕竟这样做的风险相当大。